小干扰RNA
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小干扰RNA(Small interfering RNA;siRNA)有时称为短干扰RNA(short interfering RNA)或沉默RNA(silencing RNA),是长度20到25个核苷酸的双股RNA,在生物学上有许多不同的用途。目前已知siRNA主要参与RNA干扰(RNAi)现象,以带有专一性的方式调节基因的表达。此外,也参与一些与RNAi相关的反应途径,例如抗病毒机制或是染色质结构的改变。不过这些复杂机制的反应途径目前尚未明了。
siRNA最早是由英国的大卫·包孔博(David Baulcombe)团队发现,是植物中的后转录基因沉默(post-transcriptional gene silencing;PTGS)现象的一部分,其研究结果发表于《科学》。2001年,汤玛士·涂许尔(Thomas Tuschl)团队发现合成的siRNA,可诱导哺乳动物体内的RNAi作用,结果发表于《自然》。这项发现引发了利用可控制的RNAi,来进行生物医学研究与药物开发的方法。
结构
siRNA通常是一段长21个核苷酸的双股RNA(dsRNA),其两股分别在RNA的两端超出另一端2个核苷酸,图示如下:
每一股各有一个5'磷酸基末端与一个3'羟基末端。此结构经dicer作用而得,dicer这种酶将较长的双股RNA或小发夹RNA(small hairpin RNA)切成siRNA。此外,siRNA也可经由多种不同转染(transfection)技术导入细胞内,并对特定基因产生具专一性的基因剔除(knockdown)效果。本质上,任何已知序列的基因都可以、也因此是经过适当剪裁而具有序列互补性的siRNA的作用对象。这使siRNA成为研究基因功能与药物目标的一项重要工具。
外部连结
- 设计与定性工具:
- Deqor: A web-based tool for the design and quality control of siRNAs
- siDirect: a web-based online software system for designing siRNA sequences
- siSearch: a siRNA design tool using a number of popular design methods
- SpecificityServer: a tool for checking the specificity of a given siRNA
- miRacle: tool for prediction of siRNA and microRNA targets using an algorithm which incorporates RNA secondary structure
- 数据库:
- siRNA关联企业
- Alnylam Pharmaceuticals
- Anadys Pharmaceuticals
- ArmaGen Technologies,Inc
- Benitec
- BD Biosciences
- Bionomics
- BioSpring
- Celera Genomics
- Cenix BioScience
- Ceptyr
- Finnzymes Oy
- Ingenium Pharmaceuticals
- Isis Pharmaceuticals
- Nucleonics Inc
- Pfizer Inc
- RNAi Co.Ltd
- Sigma-Aldrich
- Sirna Therapeutics, Inc.
这是一篇与医籍相关的条目。推荐您访问中医智库,阅读《小干扰RNA》经典原文。