丙酮-丁醇发酵主要是使糖转化而生成丁醇和丙酮的发酵。菌种为严格厌氧性细菌的丁酸梭菌和丙酮丁醇梭菌,在发酵中可同时产生醋酸、酪酸、乙醇等,并放出CO2和H2。从19世纪末期发现以来,作为工业生产丙酮的方法很受重视。此发酵与酪酸发酵有密切关系。