同功器官(analogous organ)指在功能上相同,有时形状也相似,但其来源与基本结构均不同。例如蝶冀与鸟冀均为飞翔器官,但蝶冀是膜状结构,由皮肤扩展形成,而鸟冀是脊椎动物前肢形成,内有骨骼外有羽毛。又如鱼腮与陆栖脊椎动物的肺,均为呼吸器官,但鱼腮腮丝来自外胚层,而肺来自内胚层。