在发生共生关系的两种生物之间，一种生物存在于另一种生物体内，特别是存在于它的细胞、组织内的，称为内部共生（endosymbiosis）；而二种生物各自以体表接触而建立的共生关系，称为外部共生。例如某种植物生长着的外生菌根等。在动物有一种生活于海葵触手间的小鱼等（一方可得以保护，而另一方则得到食物），这也是外部共生的例子。
