戊型反转录病毒属
中文名称
戊型反转录病毒属
英文名称
Epsilonretrovirus
分类类型
属
分类
戊型反转录病毒属成员
大眼梭鲈表皮肉瘤病毒(Walleye dermal sarcoma virus)、大眼梭鲈外表皮增生病毒1型(Walleye epidermal hyperplasia virus 1)、大眼梭鲈外表皮增生病毒2型(Walleye epidermal hyperplasia virus 2)、金鲈增生病毒(Perch hyperplasia virus)、蛇反转录病毒(Snakehead retrovirus)
戊型反转录病毒属基本特性
戊型反转录病毒属所有病毒成员都是外源反转录病毒。病毒基因组复杂,大小范围在11.7-12.8kb之间,除了gag、pro和pol外,病毒还编码1-3个ORF。一个为辅助蛋白(accessory protein),另外两个是粒子的结构蛋白和酶。在3个大眼梭鲈反转录病毒中,都存在ORFa,编码蛋白可能是细胞周期蛋白D(cyclin D)的同源体。大眼梭鲈表皮肉瘤病毒的其它两个ORF及蛇头反转录病毒编码单一ORF的功能未确定。鱼反转录病毒LTR长500-650nt,其中U3区450nt,R序列约80nt,U5区约75nt。大眼梭鲈反转录病毒所用的tRNA引物为tRNAHis,而蛇头反转录病毒所用的为tRNAArg。
戊型反转录病毒属各成员判定的依据是:
(1)病毒基因组序列的差异;
(2)病毒基因产物序列的差异;
本属确定成员由3种鱼反转录病毒组成,分别为大眼梭鲈肉瘤病毒、大眼梭鲈外表皮增生病毒1型和大眼梭鲈外表皮增生病毒2型。这些种类区分的依据是基因的系统发育分化。另外,还列出两个暂定成员蛇反转录病毒和金鲈增生病毒。金鲈增生病毒的聚合酶基因序列已完成序列分析。由于暂定成员中出现新的鱼反转录病毒和蛇反转录病毒,它们可能成为一个新分类单元的成员。