漂移病毒属
中文名称
漂移病毒属
英文名称
Errantivirus
分类类型
属
分类
变位病毒科>漂移病毒属
漂移病毒属成员
漂移病毒属基本特性
果蝇gypsy病毒表现为不规则的粒子,具囊膜,直径100nm,还有更小的无囊膜颗粒。根据env基因推测,囊膜蛋白相对分子质量为54×103,事实上的相对分子质量是66×103,蛋白的N端糖基化,对内糖苷酶敏感。
果蝇gypsy病毒基因组分子大小为7469bp,其中包括两个482bp的LTR。与大多数反转录病毒和反转座子不同,果蝇gypsy病毒LTR的末端是由AG…TT组成,而不是由TG…CA组成。插入的DNA侧翼包括4bp重复,插入位点选择的是YRYRYR序列。基因组RNA含有一个编码主要结构蛋白的ORF;第二个ORF-1框重叠,编码与反转录病毒PR、RT和IN同源的蛋白;第三个ORF在一个叠接的2.1kb mRNA中,编码相对分子质量为54×103的囊膜蛋白,该蛋白N端糖基化,并能加工成较小的蛋白。这种蛋白是反转录蛋白囊膜蛋白的类似物,它通过疏水跨膜区域位于病毒膜,加工位点与跨膜和表面区域的切割相似。果蝇Tom病毒的囊膜蛋白已鉴定。
果蝇gypsy病毒转录成6.5kb的基因组RNA,242nt的强负链终止种类已鉴定。479nt的正链强终止DNA种类在长度上与LTR相似,但一个种类比tRNA引物拷贝产生的种类长15-18nt。在本属成员中,不同种类病毒Gag序列的同源性低于50%。
gypsy因子与脊椎动物反转录病毒的原病毒(Provirus)最相似。每个转座子都具有LTR,这些LTR分别与推定的tRNA引物结合位点(PBS)及多嘌呤区段(PP)相邻近。在转座子的中部还含有若干开读框(ORF),与反转录病毒的gag,pol及env基因同源。在gypsy家族内,中间ORF(pol)最保守,特别在那些含有反转录病毒蛋白分解酶、反转录酶及整合酶结构域序列相似性的区域。与其他昆虫反转录转座子(如Copia病毒)不同,gypsy家族内pol各结构域的排列次序与反转录病毒的完全一致。