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脑炎后遗症的预后与病变的范围和病情的轻重有关。脑部病变较局限且未侵犯\"生命中枢\"，病情较轻时，其预后往往良好。如[[昏迷]]持续时间较长，或有频繁[[惊厥]]时，脑部[[缺氧]]及[[病理]]变化加重，预后多较差，容易留有神经、精神的后遗症。某些[[病毒]]所致的脑炎预后较差，如西方马脑炎患儿常有后遗症，年龄愈小愈严重。