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当国内发生[[烈性传染病]]，如鼠疫、霍乱时可进行这种检疫，以防止疾病扩散。这种检疫的原则是：①限制疫区和非疫区之间的交往（交通检疫）。疫区人员原则上不离开疫区，必须离开时，到非疫区后应按该病的接触者处理。对该病无免疫力的非疫区人员也禁止进入疫区。②搜索疫区内的全部[[传染源]](包括病人、[[病原体]][[携带者]]等)加以隔离、治疗。③疫区内进行消毒、灭虫或杀灭保菌动物。④接触者进行适当处理，对[[易感者]][[接种疫苗]]或用药物预防。实施各种预防措施后，到最后一个病例的接触者的[[最长潜伏期]]，仍未再发生新的病例，疫区的检疫才告终结。如鼠疫疫区的[[检疫期]]，是从发现首例鼠疫病人起，到最后一个鼠疫接触者接触后9天止。