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SCE的遗传学意义还不完全清楚，是否存在自发的SCE也还有争议，交换的机理尚未完全阐明，但它显然与DNA损伤和修复过程有关。作为一种简便和敏感的遗传学指标，它在[[诱变]]和[[肿瘤]]研究等领域中的应用十分广泛。例如，目前已知许多[[环境诱变]]剂、职业有害因素、[[抗肿瘤药物]]、[[病毒]]等都可以引起SCE率增加，Bloom[[综合征]]患者和某些肿瘤患者的SCE率也明显上升。