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淳于意象[[秦越人]]一样，并没有把医学经验的传授限定在神秘而狭小的范围内，而是广泛传授医术，他因材施教，培养宋邑、高期、王禹、冯信、杜信、唐安以及齐丞相府的宦者平等人，是秦汉时期文献记载中带徒最多的一位医家。

创立诊籍 发展医学诊籍，即医案，现在叫病历。记病历在今天的医疗中是为平常的事，是对一个合格医生的起码要求，但诊籍的初创却非易事。齐王诏问淳于意：“你给人治病，疗效很好。你的病人都是哪里人？得的什么病？施药之后。病情如何？”淳于意遵旨一回答。他记下了已愈患者的籍贯、姓名、职业、病名、病因、病性、诊断、治疗和预后，形成了最初的医案，为我们留下了研究汉代医学的宝贵史料。淳于意的医案中既有王公贵族，也有平民百姓。《史记仓公传》记载了25例病例。治愈15例，不治10例，涉及现代医学的[[消化]]、泌尿、[[呼吸]]、[[心血管]]、[[内分泌]]、[[脑血管]]、[[传染病]]、[[外科]]、[[中毒]]以及[[妇产科]]、[[儿科]]。病案中曾记载：齐国的黄长卿大宴宾客，淳于意也在座。他望见王后的弟弟宋健，急忙告诉他说：“你已病了四五天了，[[腰部]]疼痛不能俯仰，小便亦难。应趁其末传人[[五脏]]，抓紧治疗。这叫做‘肾’。”宋健说：“实这样。”他服用淳于意给他调制的“柔汤”，18天后病就痊愈了。此病类似现代的急性腰组织损伤。另有一例：齐王请淳于意为侍女们诊病。轮到一个叫竖的，竖说没有病。淳于意悄悄地告诉队长说：“竖的[[毛发]]色泽、脉象都无衰减，但病已伤及脾胃，不要让她过度劳累。到了春天，她会[[吐血]]而亡。”及至春天，果真竖摔倒在厕所里，吐血而死。这大概相当于现代[[血液]]??给我们留下了各科早期病例，有着重要的研究意义。

淳于意为使自己专志医术，辞去官职，不营家产，长期行医民间，对封建王侯却不肯趋承。赵王、胶西王、济南王、吴王都曾召他做宫廷医生，他都一一谢绝了。因常拒绝对朱门高第出诊行医，被富豪权贵罗织罪名，送京都长安受肉刑。其幼女淳于缇萦毅然随父西去京师，上书汉文帝，痛切陈述父亲廉平无罪，自己愿意身充官婢，代父受刑。文帝受到感动，宽免了淳于意，且废除了肉刑。