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在包括两对基因的杂交中，一次杂交可以测定两个基因之间的距离，通过三次杂交便可以测定三个基因的排列顺序和距离。但是在包括三对基因的一次杂交中，便可以测定三个基因的排列顺序和距离，这就是1913年由斯特蒂文特首创的三点测验方法。例如[[黑腹果蝇]]的X染色体上有[[黄体]]基因（yellow body，y；野生型灰体，y）、白眼基因（white body，y；野生型灰体，y⁺）、白眼基因（white eye， w；野生型[[红眼]]，w）和短翅基因 ，w⁺）和短翅基因 (miniature wing，m；野生型长翅，m⁺)。将黄体、白眼、短翅雌[[蝇]]和野生型雄蝇 (ywm y⁺w⁺m⁺ 即+++)杂交，将得到的雌性杂合体 再和雄性子代ywm杂交，得到子二代个体（表3）。

每一种[[转导噬菌体]]有一定的大小，只能携带一定长度的[[供体]]细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的[[头部]]中只能包装大约[[分子量]]为5.8×10的DNA，大肠杆菌的染色体DNA的分子量是28×10⁷的DNA，大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10，所以PI所能包装的 5×10⁹，所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能同时被[[转导]]，这两个基因之间的距离必然较近，而且距离愈近则共转导频率愈高，因此可以由共转导的频率来推算基因间的距离。

分子杂交和体细胞遗传学相结合的方法也可以用来测定人的基因的绝对位置。用体细胞遗传学方法，可以得到只含有某一条人类染色体的人－[[仓鼠]][[杂种细胞]]的[[克隆]]。然后可以进一步取得这一人类染色体发生各种缺失的克隆。把从这一系列缺失克隆中提取出来的 DNA吸附在[[硝酸]]纤维素滤膜上。再把人的[[基因文库]]中的各个基因的 DNA片段用P标记制成DNA片段用³²P标记制成[[探针]]，然后用探针分别与膜上吸附的 DNA进行分子杂交测验，能杂交者表示它的缺失部分不包括这一基因。再结合[[染色体显带技术]]便可以测定这一基因在染色体上的绝对位置。缺失克隆的数目愈多，测定的位置就愈精确。