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使用抗生素清除[[致病微生物]]实际上有可能增加患者发生感染的危险。有时抗生素不仅杀死有害[[细菌]]，也会杀死皮肤[[正常菌丛]]或肠内对人体有用的菌群，之后[[真菌]]或[[耐药]]菌会使机体发生第二次感染。[[二重感染]]更易发生于幼小或年老患者以及有慢性疾患或不治之症的患者。二重感染也可发生于使用多种抗生素或[[广谱]][[杀菌]]抗生素的患者。