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除溃疡性结肠炎外，大肠炎症还有许多其他的原因。因此，必须要明确大肠炎症是否由[[细菌]]或[[寄生虫感染]]所致。在乙状结肠镜检查时取[[粪便标本]]作显微镜检查和培养可检查有无细菌。血液检查可了解病人是否发生寄生虫感染。从直肠粘膜取活组织标本作显微镜检查也能发现有无寄生虫感染。还应检查有无[[性传播疾病]]，如[[淋病]]、[[疱疹]]病毒或[[衣原体感染]]（见[[家庭诊疗/性传播疾病|性传播疾病]]），尤其病人是男性同性恋者时更应检查。在患[[动脉粥样硬化]]的老年患者，大肠的炎症可能是由于肠供血不足引起。结肠癌很少引起发热或从直肠排泌脓液，但对血性腹泻病人，必须考虑肠癌的可能性。