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本医院前身为1880年北部台湾基督长老教会的[[马偕]]牧师在沪尾（现今新北市淡水区）为进行医疗传道所设立的沪尾偕医馆。1911年宣教师宋雅各医师提议迁址台北市，1912年12月26日医院落成，教会派宋雅各医师担任首任院长，改名为马偕纪念医院，以纪念马偕牧师。目前为台北地区的医学中心，除台北总院外亦有淡水院区、新竹分院、台东分院。

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*1934 [[戴仁寿]]医师成立癞病疗养院[[乐山园]]，1934年3月于台北州淡水郡八里庄启用。

*1943 [[日本政府]]辖下[[台湾总督府]]卫生课强制征用，改名[[博爱会]]本部医院

*1969 创立“自杀防治中心”

*1988 捐助设立财团法人中华民国[[儿童烫伤基金会]]

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