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[[福建医科大学附属第二医院]]、第二临床医学院是泉州地区现代医学的发祥地，迄今已走过一百二十六年的历程，现已发展成为我省主要的医疗、教学、科研基地之一，是闽南地区最早的一所级甲等综合性医院及博士、硕士研究生学位授权点单位。医院始建于1881年，为英国教会医院，原名“惠世医院”，解放后，改为晋江专区第二医院。1973年升格为福建医科大学附属第二医院。2000年成为[[福建医科大学]]第二临床医学院，2002年成为福建医学会风湿病学分会主任委员单位。医院倡导科学精神与人文精神相结合的治院方略，历来以外科技术精湛著称，上世纪四、五十年代率先在泉州地区开展大、中型[[外科手术]]，并为泉州地区培养了大批医学骨干力量。近二十年来，[[内科]]领域在相关学科带头人开拓领导下，学科建设长足发展，多个二级专业跃入省内先进水平，其中[[自身免疫]][[风湿病]]专业省内领先。现任院长是我省自身免疫风湿病学科带头人、博士生导师、国家[[卫生部]]有突出贡献中青年专家。

医院原址地处历史文化名城---侨乡泉州，占地23.07亩，建筑面积44557平方米，2006年市政府在东海组团划拨142.6亩建设我院“东海分院”，该项目现已纳入泉州市十一五发展规划，列为重点项目。

医院病床编制670张，在编职工1046人，具备高级职称186人，其中正、副教授91人，有博士研究生导师4人、硕士研究生导师35人，享受国务院特殊津贴专家4人、卫生部有突出贡献中青年专家1人。担任专业学会主任委员1人，各专业学会副主任委员（副会长）20人、常务委员（常务理事）30人、委员（理事）86人。

医院科室门类齐全，设有[[急诊科]]、内一科、[[免疫]]与[[血液内科]]、内二科、[[呼吸内科]]、[[神经内科]]、特需内科、[[康复科]]、华侨[[干部病房]]、[[儿科]]、[[中医科]]、[[骨科]]、[[普外科]]、[[肿瘤]]与[[心胸外科]]、[[泌尿外科]]、[[神经外科]]、[[妇产科]]、特需[[产科]]、[[耳鼻咽喉科]]、[[眼科]]、[[口腔科]]、[[皮肤科]]、特外一、特外三、[[手术室]]、[[麻醉科]]等27个临床科室、35个级专科，还设有11个医技科室、ICU、CCU和20个职能科室。在[[风湿免疫]]科、[[超声医学]]科、[[心血管科]]、呼吸内科、普外科、泌尿外科、骨科、[[内分泌科]]、[[耳鼻喉科]]、[[肾内科]]、[[肝胆外科]]、[[胸外科]]、[[消化道]][[肿瘤外科]]、[[整形外科]]、妇产科和眼科等专科尤为专长。医院目前拥有[[核磁共振]][[成像]]系统（MRI）、数字减影[[血管造影]]机(DSA)、螺旋CT、数字化胃肠造影机、[[流式细胞仪]]、PCR仪、[[彩色多普勒超声]]心动图、[[腹部]]彩色[[超声波]]、[[血液透析]]机、[[体外循环]]机、电子直线加速器、数字高频摄片机、骨密度仪、[[乳腺]][[钼]]靶、体外震波[[碎石机]]、[[神经]]电[[生理]]检查仪、电子[[胃镜]]、电子[[肠镜]]、电子[[支气管镜]]等先进仪器设备。[[自身抗体]]谱检测及[[内分泌]][[激素测定]]项目齐全。医院在开拓医学新领域、探索新技术新[[疗法]]方面一直处于领先地位，几十个新的诊疗技术达到国内或省内先进水平，如[[微创外科]]技术、支气管镜介入诊疗技术、[[超声]]介入诊疗技术、[[心血管]]超声诊断、[[放射学]]介入诊疗技术、[[肾移植]]、[[角膜移植]]、全喉切除发音重建术、[[人工椎体]]转换术、[[臂丛神经损伤]]修复术、体外循环心内直视手术、[[脑干]]肿瘤摘除术、[[断指再植术]]等。优秀的人才、精良的设备和设置齐全的医学专科为广大民众提供了全方位的医疗、保健服务，医院目前年[[门诊]]量50多万人次、年住院量超过2万人次、完成各类手术1.6万余台。

此外医院设有[[自身免疫病]]研究室、介入超声研究室、肝胆研究二室、耳鼻喉研究三室、[[手外科]]研究室、[[糖尿病]]研究室、[[肾病]]研究室、骨科生物力学研究室、睡眠呼吸研究室等9个研究室，其研究领域广泛，研究程度涉及[[细胞]]水平及[[分子]]水平，2001年以来共有28项科研项目获得医学科学技术进步奖，96项研究项目得到政府或研究基金的资助，有1230篇论文发表于国内外学术期刊。医院作为福建医科大学第二临床医学院及省级医学继续教育基地之一，还设有12个医学教研室，并于1998年开始招收全国统招硕士研究生、2003年招收全国统招博士研究生，迄今已招收博、硕士研究生113人。

1981年，经省政府批准，医院在本省率先建立华侨门诊、华侨病区。二十多年来接受大量来自美国、日本、新加坡、菲律宾、印度尼西亚、香港、台湾及其他东南亚地区的病人。爱国侨胞热心桑梓、慷慨解囊为医院的建设作出了积极的贡献。福建医科大学附属第二医院历任领导及全体同仁都非常珍视广大侨胞及社会各界对该医院的关爱及支持。