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宋慈64岁死于广州经略安抚使的任所，宋理宗亲自为其书写墓门，凭吊宋慈功绩卓著的一生。刘克庄在墓志铭中称他：后来宋慈的墓地迁至今福建省建阳市崇雒乡昌茂村西北。

其卒年，最早的资料宋人刘克庄《后村先生集》卷一五九《宋经略墓志铭》中说是宋无浮祐年号，当为坊刻误。若为淳祐六年（1246年），然《洗冤集录》宋慈自序在淳祐七年丁未，显误；

《洗冤集录》被誉为世界上最早的法医学专著，是中国法医学的里程碑。由于受限于当时的科学水平，其内容难免有错误。但整体而言，瑕不掩瑜，是一部符合科学精神的杰出作品。清同治六年，荷兰人首先将这本书翻译成荷兰文，传入西方。后又被翻译成多国文字，影响世界各国法医学的发展极为深远。宋慈因此被西方人称作“法医学之父”。