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据<松谷笔记>载：程钟龄有祖坟葬于某山之上，其坟低处据《松谷笔记》载：程钟龄有祖坟葬于某山之上，其坟低处(亦曰坟下)，有当地一土豪之祖坟，该坟墓之四周栽有多棵古柏，因程钟龄之祖坟居其上，为古柏之横枝所穿进，坟内之棺椁将露，程钟龄乃前往该土豪家与之相商，欲剪除其穿坟之柏枝，但土豪不允，与之相拒，程钟龄乃自往伐之。土豪乃怒，率家奴数人前往阻止。乡民皆为程钟龄鸣不平，聚数十人与土豪相争，程钟龄力阻之，但罔效。土豪一家奴已为乡民殴毙，土豪乃诉讼子宫。为不累及乡民，程钟龄遂赴官府自首。官府谳定论抵，将程钟龄解省，待秋后处决。适巡抚之母身患沉疴，诸医皆不能疗……程钟龄在狱中闻及此事，乃私贿其狱卒，赂通臬司。臬司知钟龄善医，乃为程钟龄易服更名，荐至抚署，为巡抚之母诊病，诊断书方后仍归狱服刑。遂演出了“朝为上宾，暮为重囚”之戏。经旬余，巡抚母亲之病竟获痊愈。巡抚遂以五百金子臬司，臬司乃令仆于狱中赠之，曰：“此巡抚以酬也。”程钟龄受金后复拜曰：“本人敢受此金，奈家贫复遭劫难，典质一空，留此聊以赡家，故不敢辞；惟老太夫人疾虽愈，其根尤存，恐曰后他变，当为拟以调理之方，以防其变……”臬司遂告之巡抚，遂复召程钟龄。程钟龄往见抚母，投地拜哭，乞曰：太夫人救我!我程某也。抚母大为感动，谓巡抚曰：“此君能救我命，你何不救彼以为报耶！巡抚曰，他酬报惟命，但其刑役加身，实无法挽回。抚母乃强之，命二人结为 ”金兰”。巡抚不敢违抗母命，叹曰：“案定如山，断无改判之理。无已，若逃之，则吾与臬司同受罪矣!然为母故，亦不敢辞；为保君命，只好委君屈居，遁入空门……”程钟龄遂入天都(今安徽省歙县)出家修行。　《医学心悟》一书，其多半内容乃成书于狱中。据民间流传，巡抚之母，因年迈体弱，乃患咳嗽病，经诸医治疗不效，程钟龄乃以他自创之方”止嗽散”治之，使巡抚母亲之病竟然痊愈。该方也救了程钟龄一条性命。