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多数轻症高致病性禽流感病例预后良好，且不留后遗症。某些病例（特别是H5N1感染者）病情发展迅速，出现重症[[肺炎]]、[[急性呼吸窘迫综合征]]、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、[[多脏器功能衰竭]]、、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、多脏器功能衰竭、[[败血症]]、[[休克]]及Reye综合征等多种并发症，可导致死亡。