绿菌门是一类进行不产氧光合作用的细菌。这类细菌没有已知的近亲,最近的类群为拟杆菌门。
绿菌门通常不活动(一个种具有鞭毛),形状为球状、杆状或者螺旋状。其生存要求无氧环境和光。它们的光合作用利用一种称作绿体的微囊中附在膜上的菌绿素c、d和e吸收光能。
绿硫细菌还在印度尼西亚的马塔纳湖被发现,在约110-120米的深度。物种可能包括绿硫杆菌。.