脱氧核糖核苷酸是DNA(脱氧核糖核酸,)的小分子单体。每个脱氧核糖核苷酸包括三个部分:一个碱基、一个脱氧核糖和一个磷酸基团。含氮碱基与脱氧核糖的1'号位碳原子结合,磷酸基团与脱氧核糖的5'号位碳原子结合,脱氧核糖的2'号位碳原子链接的是H原子而不是-OH 。
当脱氧核糖核苷酸聚合成DNA时,磷酸基团会与另一个脱氧核糖核苷酸的脱氧核糖的3'号位碳原子结合,通过酯化反应组成磷酸二酯键。新的核苷酸通常都是加到上一个核苷酸的3'号碳原子上,因此DNA合成的方向是从5'到3'端。