在由复合蛋白质构成的酶中，特别是能利用透析和其它方法可逆地解离其低分子成分时，称蛋白部分为脱辅基酶蛋白，低分子部分为辅酶，具有两者结合催化效应的复合蛋白质称为全酶。即辅酶 脱辅基酶蛋白全酶。当辅酶的结合强固时称为辅基，例如硫胺素焦磷酸是丙酮酸脱羧酶（EC 4．1．1．1）的辅酶，从全酶分离出后再加入到脱辅基酶蛋白中恢复其催化作用。NAD与其说是辅酶，不如说是底物。由于脱辅基酶蛋白的某个脱氢酶的作用而转变为它的还原型，此还原型可由其它脱氢酶等的作用而被氧化。
