鞭毛室是构成海绵动物沟系中心的小室,它的壁由领细胞组成,通过领细胞的鞭毛运动,把水经由小孔→流入沟→前幽门孔形成的水流朝后幽门孔→流出沟→胃腔→出水口的方向推动,摄取水中的微生物作为食物。此外并还在此处进行呼吸和排泄。单沟型(as-con type)沟系的海绵无鞭毛室,其领细胞在胃腔壁上。