RNA聚合酶Ⅱ是一个存在于真核生物细胞中的酶。它催化脱氧核糖核酸转录,合成mRNA及大多数snRNA和微RNA的前体。RNA聚合酶Ⅱ是含12个亚基的550kDa大的复合物,也是RNA聚合酶中被研究得最多的一类。在它结合到基因上游的启动子并开始转录前需要大量转录因子。