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1．[[显微镜]]检查：[[革兰氏染色]]后的显微镜检出是[[脑脊液]]微生物学检查中的第一步，这在[[化脓性脑膜炎]]时其阳性率约为60-90%。如果脑脊液中[[细菌]]数量小于1000个/μl时可出现[[假阴性]]，但可以通离心沉淀[[涂片]]来提高阳性率。有人提出用[[吖啶橙]][[荧光染料]][[染色]]代替革兰氏染色，可提高细菌出率。[[结核杆菌]]用ZiehlNeeison染色阳性率仅40左右，可[[罗丹明]]B荧光染色来提高检出率。[[新型隐球菌]]检查一般用印度墨汁染色Berned认为有假阳性，推荐用[[苯胺]]黑代替印度墨汁。
2．[[细胞培养]]：主要适用于[[脑膜炎]][[奈瑟菌]]、[[链球菌]]、[[葡萄球菌]]、[[大肠埃希菌]]、[[流感嗜血杆菌]]等和分离培养。[[血平板]]和巧克力平板是分离用的最基本[[培养基]]。巧克力平板需放入[[二氧化碳]]环境中，有利于检出脑膜炎奈瑟菌、[[肺炎]]链球菌及流感嗜血杆菌等。为了分离鉴别[[革兰氏阴性]]杆菌还应增种中国蓝平板。如果培养及时一般[[需氧培养]]的阳性率约为80%左右。若培养之前使用过[[抗生素]]，则病菌较难分离出来。在脑脊液培养中还应注意防止污染。[[结核菌培养]]第一次敏感性约为50%，连续多次培养才能提高其阳性率。在重视[[真菌]]和[[厌氧菌]]的培养。
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2．[[细胞培养]]：主要适用于[[脑膜炎]][[奈瑟菌]]、[[链球菌]]、[[葡萄球菌]]、[[大肠埃希菌]]、[[流感嗜血杆菌]]等和分离培养。[[血平板]]和巧克力平板是分离用的最基本[[培养基]]。巧克力平板需放入[[二氧化碳]]环境中，有利于检出脑膜炎奈瑟菌、[[肺炎]]链球菌及流感嗜血杆菌等。为了分离鉴别[[革兰氏阴性]]杆菌还应增种中国蓝平板。如果培养及时一般[[需氧培养]]的阳性率约为80%左右。若培养之前使用过[[抗生素]]，则病菌较难分离出来。在脑脊液培养中还应注意防止污染。[[结核菌培养]]第一次敏感性约为50%，连续多次培养才能提高其阳性率。在重视[[真菌]]和[[厌氧菌]]的培养。
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