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中枢神经细胞瘤大多具有良性[[生物学]]行为，多数预后良好。由于肿瘤在脑室壁附着处存在着[[浸润]]生长的可能性，单纯手术将肿瘤全切不能防止肿瘤复发。有研究报道，中枢神经细胞瘤用单纯手术肿瘤全切病人均在3年内复发，而结合术后放疗，即使肿瘤部分切除，多数病人可得到长期治愈效果。另有研究总结20例中枢神经细胞，除3例手术死亡外，随访时间最长者约19年。国内作者报道13例侧脑室[[神经细胞瘤]]，其中对6例术后放疗病人进行1～8年随访未见肿瘤复发，其中1例术中只做活检术，放疗后肿瘤完全消失，随访2年，亦无肿瘤复发，而另1例术后未放疗，16个月后肿瘤复发。一般中枢神经细胞瘤5年[[生存率]]为81%，全切者5年生存率可达90%。放疗对次全切除者有效，可延长生存期。

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