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中学毕业后，陈竺作为知青，于1970年4月下放到江西省信丰县小江公社山香大队的老圳头生产队<ref name="余玮">余玮中学毕业后，陈竺作为知青，于1970年4月下放到江西省信丰县小江公社山香大队的老圳头生产队余玮. [http://health.people.com.cn/GB/14740/22121/8413942.html 陈竺：从赤脚医生到卫生部长 "会慎重慎重再慎重"]. 人民网。1973年11月，陈竺离开信丰，来到江西横峰县凭着自学成为一名赤脚医生[http://www.worldchineseweekly.com/weekly_cn/article/show.php?itemid=2478 陈竺：从知青到卫生部长]。1975年，他被推荐到江西省上饶地区卫生学校医士专业学习。1977年11月至1978年9月留校任内科教研组教师。[http://news.sina.com.cn/c/2007-06-29/151513340161.shtml 无党派人士陈竺接替高强出任卫生部长][http://news.sohu.com/20080317/n255757573.shtml 部长档案：“三国院士”陈竺]

1978年，陈竺被推荐到[[上海交通大学医学院|上海第二医学院]]附属[[瑞金医院]]内科进修。当年10月，高校恢复研究生招生考试，陈竺以总分第二、血液学专业第一的好成绩被录取，师从著名的[[血液病学]]专家[[王振义]]；并于1981年获血液病学硕士学位。<ref name="余玮"/>

毕业后，陈竺成为瑞金医院血液病研究室的一名内科住院医师。1984年，获机会前往法国求学；在巴黎第七大学圣路易医院血液中心实验室任外籍住院医师，并攻读博士学位，主修分子生物学。后做博士后研究。1986年1月，陈竺的夫人、研究生同学[[陈赛娟]]来到陈竺所在研究所攻读细胞遗传学博士学位，两人合作发表了6篇论文，在[[白血病]]分子生物学研究领域取得了重要成果。<ref name="余玮"/>

1989年7月，陈竺夫妇回国。此后，他牵头承担了一大批国家重点科研项目，在[[血液学]]、[[分子生物学]]等领域取得了很多突破性成果。历任瑞金医院内科主治医师，上海血液学研究所分子生物学中心实验室主任、研究员，上海血液学研究所副所长、所长。1995年11月3日，陈竺当选中国科学院（生物学部）院士，是当时中国医学界最年轻的院士<ref name="余玮"/>。1997年出任上海市科协副主席；1998年，出任中国国家人类基因组南方研究中心主任，成为中国国家“973”计划首席科学家；2000年10月，出任中国科学院副院长。等领域取得了很多突破性成果。历任瑞金医院内科主治医师，上海血液学研究所分子生物学中心实验室主任、研究员，上海血液学研究所副所长、所长。1995年11月3日，陈竺当选中国科学院（生物学部）院士，是当时中国医学界最年轻的院士。1997年出任上海市科协副主席；1998年，出任中国国家人类基因组南方研究中心主任，成为中国国家“973”计划首席科学家；2000年10月，出任中国科学院副院长。