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教学上，医院实行了院糸合一的体制，担负着临床本科、硕士、博士生的教学任务。我院现有博士学位授权点3个（[[中医妇科学]]、[[中医内科]]学、中西医结合临床），硕士学位授权点8个（中医内科学、[[中医外科学]]、中医妇科学、[[中医儿科学]]、[[中医骨伤科学]]、中医[[五官科]]学、[[针灸]]推拿学、中西医结合）。专业覆盖了中医学、中西医结合等一级学科下的全部二级学科，在学位授权点建设方面显示了良好的发展势头。尤其2003年中西医结合临床专业的设立，实现了我院高级人才培养的历史性突破，成为我院学位与研究生教育发展历史的里程碑。
该院拥有博士指导教师25名，硕士指导教师94名，导师规模迅速扩大，年龄结构年轻化，学历结构高层次化。有力地推动了研究生导师队伍建设，是我校研究生教育发展的根本保证。国家级重点学科1个：中医妇科学学科；国家中医药管理局重点学科2个：中医妇科学学科、中医内科（[[内分泌]]学科）；省教育厅重点学科4个：中医妇科学学科、中医内科学学科、中医骨伤科学学科、中西医结合临床学学科；省人事厅重点学科（2个） 中医内科[[心血管]]学科 中医内科[[消化]]学科；省中医管理局重点学科（6个）中医耳鼻喉学科，中西医结合[[神经内科]]学科，中西医结合[[肾病]]学科，中西医结合[[呼吸]]学科， 中西医结合内分泌学科 ， 中医[[皮肤]]学科 。
科研上，我院坚持科技兴院，现有国家中医药管理局中医药科研实验室（三级）2个，即[[中药]]药理实验室（妇科）、[[分子]][[生物学]]实验室，省级研究所1个（心[[肺病]]研究所）。“十五”期间临床医学院共立项168项，已完成95项，在研71项。其中国家[[自然科学]]基金项目3项；高等学校博士学科点专项科研基金项目1项；国家中医管理局科研基金项目6项；黑龙江省自然科学基金项目15项；省攻关科研项目16项；市科委科研基金项目21项；省教育厅科研基金项目16项；省中医局科研基金项目29项；中医药大学科研基金项目61项，总计获得科研经费430.6万元。共获得各级成果奖53项。其中省政府二等奖5项；三等奖14项；国家级学会科技奖三等奖4项；厅局级一等奖6项；二等奖11项；三等奖13项。
