乙酰乙酰辅酶A是甲羟戊酸途径中合成β-羟基-β-甲戊二酸单酰辅酶A(HMG-CoA)的前体,是胆固醇合成的必要物质,在肝脏中的酮体合成里也有一定作用。在组织中的酮体分解途径中,它的合成与分解则与HMG-CoA无关。
它由合成两分子乙酰辅酶A而来,再由与一分子乙酰辅酶A合成HMG-CoA。而在亮氨酸的代谢过程中,上述反应按相反方向进行。