大肠杆菌O104:H4型
<ref>标签；未填name属性的引用必须填写内容，导致了2011年O104:H4型大肠杆菌疫情。其血清型O104:H4中“O”指的是O抗原（菌体抗原，somatic antigen），“H”指的是H抗原（鞭毛抗原，flagellar antigen），这两种抗原是区分大肠杆菌的重要方式之一引用错误：无效<ref>标签；未填name属性的引用必须填写内容。
流行病学
造成出血性大肠杆菌主要致病的毒素称为“志贺样毒素”，可损伤肠道黏膜，甚至进入血液中破坏红血球，导致溶血性病变，这种症状在肾脏中最为明显，常导致急性肾衰竭，即为溶血性尿毒综合症[1]。
大部分肠出血性肠炎是由O157：H7型的大肠杆菌引起的，但也有少部分是由其他血清型的大肠杆菌引起[1]。如1994年发生于美国蒙大拿州的出血性结肠炎，即是由O104：H21型的大肠杆菌引起引用错误：无效<ref>标签；未填name属性的引用必须填写内容。造成本次疫情的O104:H4型之前也曾造成零星个案，如2004年一位并发溶血性尿毒综合症的韩国妇女，其粪便中分离出O104:H4大肠杆菌引用错误：无效<ref>标签；未填name属性的引用必须填写内容引用错误：无效<ref>标签；未填name属性的引用必须填写内容。
基因定序
在2011年O104:H4型大肠杆菌疫情爆发后，位于中国深圳的华大基因研究院（BGI）首先于6月2日定序出造成疫情的大肠杆菌O104:H4型的基因[2]，半天后德国明斯特大学医院卫生研究所也完成了基因定序[3]，结果显示这种品系的大肠杆菌与2001年德国从腹泻病人体内分离出的菌株01-09591，及2002年从中非长期腹泻爱滋病患者粪便中分离的菌株55989具有高度相似性，与中非菌株相比多了志贺样毒素（Shiga-like toxin）基因，与2001年德国的分离株相比则毒性基因大致吻合，但多了许多抗药性的基因，因此对氨基糖甙、大环内酯、磺胺、头孢菌素、单酰胺菌素、青霉素和链霉素等多种抗生素有抗药性。研究人员据此推测2001年的分离株可能是这次疫情菌株的直接祖先[4]。
德国明斯特大学卫生研究所所长黑尔格·卡希于6月10日表示，此型大肠杆菌的原始宿主很有可能就是人类，因为尽管有几种O104型的大肠杆菌以其他动物为宿主，但目前没有证据证明O104:H4型的大肠杆菌能在其他动物的体内生存引用错误：无效<ref>标签；未填name属性的引用必须填写内容。
