子囊菌门是真菌界中种类最多的一个门，其中除酵母亚门为单细胞外，其余种类都是多细胞的，有分枝、有隔的菌丝组成的。
在无性繁殖时，会出芽或分生孢子；有性繁殖时都能形成有盖或无盖的、棒状或卵形的子囊，通常子囊内进行减数分裂生成八个子囊孢子，子囊分散、单细胞种类子囊裸露、多细胞种类子囊包在由菌丝结成的子实体内，称为子囊果。
子囊菌门的真菌都是寄生或腐生，对人类生活非常重要的有酵母菌、冬虫夏草、青霉菌、可以食用的羊肚菌等，也有很多种为植物致病菌。
分类
子囊菌门是一类较高等的真菌，可分成以下三个亚门：
- 外囊菌亚门 (Taphrinomycotina)
- 粒毛盘菌纲 Neolectomycetes
- 肺孢子菌纲 Pneumocystidomycetes
- 裂殖酵母纲 Schizosaccharomycetes
- 外囊菌纲 Taphrinomycetes
- 酵母亚门 (Saccharomycotina)
- 盘菌亚门 (Pezizomycotina)
- 星裂菌纲 Arthoniomycetes
- 座囊菌纲 Dothideomycetes
- 散囊菌纲 Eurotiomycetes
- 虫囊菌纲 Laboulbeniomycetes
- 茶渍纲 Lecanoromycetes
- 锤舌菌纲 Leotiomycetes
- 李基那地衣纲 Lichinomycetes
- 圆盘菌纲 Orbiliomycetes
- 盘菌纲 Pezizomycetes
- 粪壳菌纲 Sordariomycetes
- 刺盾炱纲 Chaetothyriomycetes
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