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[[菌毛]]是侵袭力的基础，是[[痢疾杆菌]]致病的主要因素之一。此外，菌体表面的K[[抗原]]也与侵入人体[[上皮细胞]]的能力有关。痢疾杆菌随食物进入胃部后，若胃酸分泌正常，可被胃酸杀死，即使[[细菌]]进入肠道，也可被肠道内的分泌性[[抗体]](IgA)和肠道[[正常菌群]]所排斥。某些足以降低人体全身和胃肠道局部防御功能的因素，如[[慢性病]]、[[过度疲劳]]、受冻、饮食不当及[[消化道]]疾患等，则有利于痢疾杆菌借助菌毛[[粘附]]于回肠末端和[[结肠]]粘膜上皮细胞上，然后进入细胞内生长繁殖，最后引起[[细胞破裂]]，导致肠粘膜损伤及[[溃疡]]，引起粘膜炎症而致[[腹泻]]。一般情况下，痢疾杆菌只在粘膜[[固有层]]内繁殖，并形成[[感染]]病灶，很少侵入[[粘膜下层]]。细菌侵入血流者较罕见。有毒力的痢疾杆菌对上皮[[细胞]]的侵入作用是致病的先决条件，是导致感染的重要原因。

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