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改革开放以来，学校先后与美、英、加、日、俄、法、德、澳、荷兰、瑞士、瑞典等国家及香港地区的大学建立了学者进修、留学、参加学术交流和科学研究等合作关系，聘请了98位来自美、日、英、法、德、加拿大、澳大利亚、瑞典、荷兰、泰国及香港地区的医学专家为我校名誉教授和客座教授。
以王智彪教授为首的学术团队自1988年以来致力于超声治疗技术的研究，坚持走自主创新之路，使我国自主发明的大型医疗设备（海扶刀）首次进入世界前列。该创新团队先后承担了70余项国家和地方科研项目，包括国家自然科学基金委重点项目3个、杰出青年基金项目1个及10余个面上项目，国家“九五”重点科技攻关项目，教育部创新团队发展计划项目、教育部骨干教师资助计划，国家火炬计划以及省部级攻关项目等，在国内外刊物上公开发表学术论文400余篇，主编了《实用超声治疗学》、《医学信号数字处理技术及应用》、《临床心电信号学》等五部，译著《生物学中的微计算机模型》等三部。2000年获得国家技术发明二等奖，国际专利5件（美国、日本、加拿大、新加坡、俄罗斯专利已获准），国内专利10项。
==院系设置==
重庆医科大学医学二系成立于1978年，1996年更名为重庆医科大学第二临床学院。学院有教研室23个，历年来承担了学校七年制临床医学、五年制临床医学、七年制临床医学（儿科医学方向）、五年制临床医学（儿科医学方向）、五年制[[医学影像学]]、临床医学留学生班、五年制预防医学、五年制预防医学（卫生检验方向）、四年制预防医学（营养与食品卫生方向）、四年制药学（临床药学方向）、五年制中医学（中西医结合方向）、五年制中医学（康复治疗方向）、五年制针灸推拿学、五年制中医学（中医骨伤方向）、七年制临床医学（[[物理医学]]方向）、五年制医学影像学专业（物理医学方向）、五年制生物医学工程（医疗器械方向）、三年制医学影像学、三年制中西医结合专业、三年制中医骨伤专业、三年制中西医结合专业专升本（成人业余）、三年制中西医临床医学专升本（成人业余）、四年制中西医结合（成人业余）、三年制针灸推拿学、临床医学梁山班等不同层次和专业的临床课程和生产实习的重任，现已成为办学层次齐全、规模较大的临床医师培养基地。
==重点学科==
1956年，上海第一医学院儿科系全迁来渝创建重庆医学院儿科系，成为全国最早建立的四大儿科系之一，是卫生部、联合国儿童基金会在中国最早建立的四大儿童[[急救中心]]之一。当年，一批矢志建设西部、发展西部儿科医学事业的开拓者来到这里，他们是：首任院长、第一任《中华儿科杂志》主编陈翠贞教授、中国[[小儿外科]]奠基人之一王赞尧教授、全国知名小儿传染病专家石美森院长、[[消化]]病专家徐谷教授、[[肾病]]专家沈锦教授、[[新生儿病]]专家吴仕孝教授、[[血液]]病专家张锦教授、儿童保健学专家郑惠连教授、小儿传染病专家陈季方教授等。
重庆医科大学神经病学为国家重点学科（2007）。[[重庆医科大学附属第一医院]][[神经内科]]是医院的重点、特色学科。该科室始建于1958年，由我国著名神经病学专家傅雅谷、沈鼎烈、徐越和董为伟教授从上海第一医科大学[[华山医院]]神经内科来渝创建，经过半个世纪几代人的努力建设，现科室拥有重庆市唯一的神经病学重点实验室及西南地区唯一的神经病学研究所。作为集医疗、教学、科研为一体的专业性科室，我们各方面的条件长期以来都处于国内领先水平，所取得的成绩在国内及西部地区同类学科中均名列前茅。另外，科室还与美国哈佛大学医学院附属麻州总医院、美国Johns Hopkins University医学院、美国Miami University医学院、美国Sunnyvale[[帕金森病]]研究所建立了良好的双边学术交流合作关系。至此，该科在西部地区乃至全国都享有盛誉。
