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*1956年，上医部分师生分迁到渝成立重庆医学院，1985年改名为[[重庆医科大学]]。
*1985年，更名为“上海医科大学”。
*1994年，通过[[211工程]]（中国21世纪重点建设100所大学计划）预审，为上海第一所获此资格的高校。
*2000年，与原[[复旦大学]]合并，组建新的复旦大学。上海医科大学被拆分为若干直属于复旦大学的院系，“上医”名称一度被取消。
*2001年，撤销基础医学院和临床医学院的建制，合并组建新的医学院，经师生校友争取，命名为“上海医学院”。
{| class="wikitable" width=450
|+ 历任院长/校长
|-
! width="150" align ="center"|职务|| width="100" align ="center"|姓名|| width="200" align ="center"|任期
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|- style="text-align:center;"
| colspan="3" | '''国立第四中山大学→国立江苏大学→[[国立中央大学 (南京)|国立中央大学]] 医学院'''
;国家重点实验室
*医学神经生物国家重点实验室（基础医学院） ;部级重点实验室 *医学分子病毒学教育部卫生部重点实验室（基础医学院）
*分子医学教育部重点实验室（基础医学院）
*公共卫生安全教育部重点实验室 （公共卫生学院）
*糖复合物卫生部重点实验室（基础医学院）
*医学技术评估卫生部重点实验室 （公共卫生学院）
*抗生素临床药理卫生部重点实验室（华山医院） *手功能重建卫生部重点实验室（华山医院）
*听觉医学卫生部重点实验室（眼耳鼻喉科医院）
*病毒性心脏病卫生部重点实验室（中山医院）
*近视眼研究卫生部重点实验室（眼耳鼻喉科医院）
*新生儿疾病卫生部重点实验室（儿科医院）
