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{| class="wikitable"
|-
! 残基名称
! 三字母代码
! pKa[http://www.bmrb.wisc.edu/referenc/aapka.html Amino Acid pKa values]，表中显示的为氨基酸侧链的pKa值。
! ''VdW''体积 (ų)
! 带电（C）， 极性（P）， 疏水性（H） |-
| [[丙氨酸]]（Alanine）
| ALA
| 13.0
| 71
|
| 67
| H
|-
| [[精氨酸]]（Arginine）
| ARG
| 148
| C+
|-
| [[天冬酰胺]]（Asparagine）
| ASN
| 9.9
| 114
|
| 96
| P
|-
| [[天冬氨酸]]（Aspartate）
| ASP
| 91
| C-
|-
| [[半胱氨酸]]（Cysteine）
| CYS
| 86
| P
|-
| [[谷氨酸]]（Glutamate）
| GLU
| 109
| C-
|-
| [[谷氨酰胺]]（Glutamine）
| GLN
| 10.8
| 128
|
| 114
| P
|-
| [[甘氨酸]]（Glycine）
| GLY
| 7.8
| 57
|
| 48
| |-
| [[组氨酸]]（Histidine）
| HIS
| 118
| P,C+
|-
| [[异亮氨酸]]（Isoleucine）
| ILE
| 4.4
| 113
|
| 124
| H
|-
| [[亮氨酸]]（Leucine）
| LEU
| 7.8
| 113
|
| 124
| H
|-
| [[赖氨酸]]（Lysine）
| LYS
| 135
| C+
|-
| [[甲硫氨酸]]（Methionine）
| MET
| 3.8
| 131
|
| 124
| H
|-
| [[苯丙氨酸]]（Phenylalanine）
| PHE
| 3.3
| 147
|
| 135
| H
|-
| [[脯氨酸]]（Proline）
| PRO
| 4.6
| 97
|
| 90
| H
|-
| [[丝氨酸]]（Serine）
| SER
| 6.0
| 87
|
| 73
| P
|-
| [[苏氨酸]]（Threonine）
| THR
| 4.6
| 101
|
| 93
| P
|-
| [[色氨酸]]（Tryptophan）
| TRP
| 1.0
| 186
|
| 163
| P
|-
| [[酪氨酸]]（Tyrosine）
| TYR
| 141
| P
|-
| [[缬氨酸]]（Valine）
| VAL
| 6.0
| 99
|
| 105
| H
<div align="left">
{| border="2" style="border-collapse: collapse;"
|-
| 肽键
| 平均长度
| 氢键
| 平均长度（±30）
|-
| C<font face="Symbol">α -</font> C
| 153 [[皮米|pm]]
| O-H --- O-H
| 280 pm
|-
| C - N
| 133 pm
| N-H --- O=C
| 290 pm
|-
| N - C<font face="Symbol">a</font>
| 146 pm
早在1951年，第一个蛋白质结构解出前7年，鲍林和他的同事就利用已知的键长和键角提出了α螺旋和β折叠的结构。PAULING L, COREY RB, BRANSON HR. Proc Natl Acad Sci U S A. 1951 Apr;37(4):205-11. The structure of proteins; two hydrogen-bonded helical configurations of the polypeptide chain. PMID 14816373α螺旋和β折叠都是将主链上的氢键[[供体]]和[[受体]][[饱和]]的一种方式。这两个二级结构仅依赖于主链骨架，即所有氨基酸的共同部分，这就解释了为什么这两个二级结构频繁地出现于大多数的蛋白质结构中。随着越来越多的蛋白质结构得到解析，更多的二级结构被发现，如各类Loop和其他形式的螺旋。二级结构都有自己独特的几何构架，即二面角ψ和φ有特定的值，处于Ramachandran图的特定区域。二级结构还包括转角、Loop和其他一些不常见的二级结构元素（如3<sub>10</sub>螺旋等）。除了有规则的二级结构以外，主链骨架的其他部分就被称为无规则卷曲。
{| align=center |- | | | |-
|}
==外部链接==
*如何利用贝叶斯计算法从NMR数据进行结构计算 ──
*[https://prosa.services.came.sbg.ac.at/prosa.php ProSA-web] 查找实验测定或理论计算所获得的蛋白质结构中可能出现的错误的网络服务器
*[https://flipper.services.came.sbg.ac.at/ NQ-Flipper] 可以对蛋白质结构中Asn和Gln的异构体进行检查的网络服务器
