然而，rRNA树有可能将演化太快的类群放错位置（比如[[微孢子虫]]）。有人认为生物的根应该在真细菌之内，很多真细菌的类群在古细菌之前分支出来，很晚古细菌和真核生物才彼此分开。
== 三域特征比较Michael Madigan, John Martinko: Brock Biology of Microorganisms (11th Edition). Prentice Hall, 11th Edition. ISBN 978-0-13-144329-7 三域特征比较 ==
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