球囊菌门
球囊菌门（学名：Glomeromycota，AM fungi），又称聚合菌门、锈球菌门，是真菌界的七个门之一，目前约已发现400种生物。聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根（arbuscular mycorrhizas, AM），这种共生构造可协助植物吸收土壤中的无机盐，并据信是早期植物能适应陆地环境的重要关键。超过八成的维管束植物都有由球囊菌构成的丛枝菌根，且在苔藓植物等没有真实根部构造的植物中亦有树状菌根，可见丛枝菌根在陆地生态系的重要性。
共生关系
细胞中丛枝菌根的显微构造]] 聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根（arbuscular mycorrhizas, AM），也因此被称为“AM Fungi” 。形成菌根的聚合菌广泛的分布在全世界的土壤中，和植物的根（或苔藓植物的假根）形成共生关系，它们也可以生存在盐度很高的沼泽中，和附生植物形成共生关系。
一种称为Geosiphon pyriformis的聚合菌（属于球囊霉目）和蓝绿菌中念珠藻属的Nostoc punctiforme形成内共生关系，在此共生关系中，球囊菌形成多核的细胞，并将念珠藻属的蓝绿菌“吞入”。过去常以“Geosiphon pyrifome”称呼此内共生体，但现在这个名称只用来专指真菌，内共生体改以“Geosiphon symbiosis”称呼。聚合菌-念珠藻的共生关系是目前发现的唯一一种真菌和蓝绿菌的内共生关系，它不属于地衣，因为它们涉及细胞内的连结，且就结构与演化上的证据而言这种关系比较类似丛枝菌根。
在整个系统中，念珠藻可独立生存，所以球囊菌是义务性共生者，不过聚合菌除了与念珠藻形成丛枝菌根外，也可与植物形成树状菌根，这个说法尚未获得证实，但已有若干证据支持的孢子（称为Glomerospores）。在某些情况中，孢子生成后会进一步形成球囊状的构造（saccule）。
种系发生学
早期对于球囊菌门的研究多半着重在其型态及土壤中、菌根里外孢子堆的构造，透过现代分子序列的分析才被并入球囊菌门的分类共同被提升为科，合为球囊霉目（属于接合菌门）。1998年Cavalier与Smith提出“球囊菌纲（Glomomycetes）”的概念，并将球囊霉目归入其中（仍属接合菌门）。后来经Schüßler对该目下部分物种小亚基rRNA（SSUrRNA）的分析发现球囊菌目可自组一个门，便将其由接合菌门移出，新成立“球囊菌门”，又因发现有能产生类似球囊霉目孢子的种类应该属于另一个更分歧的种系，而新增了类球囊霉目（Paraglomerales）、原囊霉目（Archaeosporales）与多孢囊霉目（Diversisporales）三个目或属比较合适。
透过对小亚基rRNA（SSU rRNA）的分析研究发现，球囊菌门在演化上应与双核亚界有共同的祖先。
外部连结
- Tree of Life Glomeromycota
- Glomeromycota at the International Culture Collection of VA Mycorrhizal Fungi (INVAM)
- Glomeromycota at the University of Sydney Fungal Biology s|ite
- 'AMF-phylogeny' - 'Glomeromycota database' web-site at the University of Munich
